Minimiert und im Tray gleichzeitig geht scheinbar nicht (so einfach).
Aber in dem Bild siehst du, wie du VLC zumindest in den Tray bringst.
Und minimiert geht ganz einfach, indem du unter Eigenschaften der Verknüpfung "Ausführen minimiert" auswählst.
Aber wie gesagt, wenn du auf Tray stellst, geht das minimiert starten nicht mehr.