Du könntest an den PC einen Reader seriell anschliessen und den 2. Reader (USB) könntest Du so ansprechen (allerdings nicht selber getestet):
SLOT=/dev/ttyUSB0:1:1:1:1:997:username:password
Falls das nicht gehen sollte kannst Du auch für 10€ ne serielle PCI Schnitstellenkarte mit rein bauen für einen zusätzlichen COM2.

Was für Vorteile gibt es wen das Sharing ein Pc übernimmt.
Fällt mir jetzt spontan nicht wirklich was ein. Der Rechner sollte natürlich immer laufen und es muss RemoteEMM aktiv sein, damit die Karten die "Updates" bekommen. Ich würde das Sharing den Boxen überlassen. Da Du ne Dream hast kannst Du damit ja 2 Karten sharen und damit muss nur eine Box laufen. Die Dream brauch mit Sicherheit auch weniger Strom wie ein PC.